Emergindo do caos de uma guerra global, a cidade de Utopia é habitada por humanos e bioróides (humanos artificiais). À primeira vista, tudo parece harmonioso, mas tensões estão à espreita. Nesse cenário aparentemente perfeito, surge uma sobrevivente das guerras, Deunan Knute, que carrega um legado que se revelará de importância crucial para o futuro da humanidade. "Appleseed" é um anime que explora temas como a coexistência entre humanos e seres artificiais, e apresenta dilemas éticos em um mundo pós-apocalíptico. Deunan, a protagonista, deve enfrentar não apenas desafios externos, mas também questões internas sobre sua identidade e o papel dos bioróides na sociedade.