Em 2010, o Sacro Império de Britannia está se estabelecendo como uma nação militar dominante, começando com a conquista do Japão. Renomeado para Área 11 após sua rápida derrota, o Japão tem enfrentado resistência significativa contra esses tiranos em uma tentativa de recuperar sua independência.

Lelouch Lamperouge, um estudante britanniano, infelizmente se vê envolvido em um fogo cruzado entre as forças armadas britannianas e os rebeldes da Área 11. No entanto, ele consegue escapar graças à aparição oportuna de uma garota misteriosa chamada C.C., que lhe concede o Geass, o ""Poder dos Reis"". Percebendo o vasto potencial de seu novíssimo ""poder de obediência absoluta"", Lelouch embarca em uma jornada perigosa como o vigilante mascarado conhecido como Zero, liderando um implacável ataque contra Britannia para se vingar de uma vez por todas.