Crime é atemporal. No ano de 2071, a humanidade se espalhou pela galáxia, ocupando a superfície de outros planetas com assentamentos semelhantes aos da Terra. Essas novas sociedades são assoladas por assassinatos, uso de drogas e roubos, e fora da lei intergalácticos são caçados por um número crescente de durões caçadores de recompensas. Spike Spiegel e Jet Black perseguem criminosos pelo espaço para ganhar a vida de maneira humilde. Sob sua aparência despreocupada e desleixada, Spike é atormentado pelo peso de seu passado violento. Enquanto isso, Jet lida com suas próprias memórias conturbadas enquanto cuida de Spike e da Bebop, sua nave. A dupla é acompanhada pela bonita golpista Faye Valentine, o excêntrico garoto Edward e Ein. À medida que desenvolvem laços e trabalham para capturar um elenco colorido de criminosos, as vidas da tripulação da Bebop são perturbadas por uma ameaça do passado de Spike. À medida que o plano maníaco de um rival continua a se desenrolar, Spike deve escolher entre a vida com sua nova família ou a vingança por suas velhas feridas. Com uma mistura de ação, drama e uma pitada de humor, a jornada dos viajantes espaciais revela não apenas suas batalhas externas, mas também suas lutas internas, enquanto buscam por redenção e um lugar no universo.