No 11º ano da Era Meiji, o fim do xogunato dos samurais e a proibição das espadas deixaram cicatrizes duradouras no Japão. Descontentes com as mudanças recentes, muitos dos antigos samurais conspiram contra o novo governo, incitando uma onda de mortes. Para enfrentar este movimento, o governo constrói uma prisão colossal no meio do Lago Biwa. Extraoficialmente designado para ajudar a polícia a prender criminosos, Tenka Kumou também atua como barqueiro para a prisão de Lake Biwa com a ajuda de seus dois irmãos mais novos: Soramaru, ambicioso, e Chuutarou, entusiasmado. Juntos com o antigo ninja Fuma, Shirasu Kinjou, os irmãos Kumou levam uma vida frugal e alegre dedicada principalmente ao estudo e ao treinamento. No entanto, por trás desta rotina diária relativamente tranquila, o espectro da maldição ""Orochi"" começa a espalhar sua sombra sobre a cidade de Oumi. Segundo a lenda, a cada trezentos anos, Orochi se reincarna em um hospedeiro humano - e acredita-se que este seja o prenúncio de uma catástrofe iminente. Conforme diversos grupos se chocam em busca do hospedeiro de Orochi, alguns têm como objetivo selar a maldição, enquanto outros têm planos mais sombrios em andamento.