Enquanto outras escolas no Japão competem pelo título de melhor time de futebol do país, o clube de futebol da Escola Raimon, Inazuma Eleven, luta para sair da beira da extinção. O neto do primeiro goleiro e capitão da Inazuma Eleven, Mamoru Endou, aceita o desafio de levar de volta o clube, que há muito tempo vem sendo negligenciado. Para isso, ele precisará de um pouco de ajuda e muita sorte.

Mamoru Endou encontra esperança nas mãos de Shuuya Gouenji, um jovem jogador brilhante que desistiu do futebol. Mamoru está determinado a recrutar Shuuya e outros novos jogadores para se juntar à sua equipe, não importa qual seja o custo. Será que sua paixão e determinação são suficientes para salvar o clube moribundo? Ou não há mais esperança para a equipe?