Anos após um mal antigo ter sido resgatado das profundezas do mar, Joutarou Kuujou está pacificamente preso em uma cela de prisão japonesa. Ele não cometeu nenhum crime, mas exige que não seja libertado, acreditando que foi possuído por um espírito maligno capaz de prejudicar aqueles ao seu redor. Preocupada com seu filho, Holly Kuujou pede a seu pai, Joseph Joestar, que convença Joutarou a deixar a prisão. Joseph informa ao neto que o ""espírito maligno"" é na verdade algo chamado de ""Stand"", a manifestação física do espírito de luta de alguém que pode adotar uma variedade de formas letais. Depois de uma batalha ardente com o amigo de Joseph, Mohammed Avdol, Joutarou é forçado a sair de sua cela e começa a aprender como controlar o poder de seu Stand.

No entanto, quando um Stand desperta dentro de Holly e ameaça consumi-la em 50 dias, Joutarou, seu avô e seus aliados devem buscar e destruir o vampiro imortal responsável por sua condição. Eles devem viajar pela metade do mundo até o Cairo, no Egito, e ao longo do caminho, lutar contra usuários de Stands ferozes que tentam frustrá-los. Se Joutarou e seus aliados falharem em sua missão, a humanidade está destinada a um destino sombrio.