Ainda em busca de seu ambicioso objetivo, a engenhosa traficante de armas Koko Hekmatyar, o soldado criança inexpressivo Jonathan “Jonah” Mar e o restante de sua equipe continuam suas atividades mercenárias. Desde assassinos profissionais até militares privados, o trabalho do grupo constantemente os coloca de frente com o perigo.

No entanto, conflitos internos surgem logo após a revelação de que Renato ""R"" Socci, um dos guarda-costas de Koko, é um agente disfarçado da ""Operação Undershaft"" - um plano elaborado pela CIA para infiltrar-se na HCLI e explorar Koko como uma ferramenta. Chocada com sua traição, a liderança de Koko é necessária agora mais do que nunca para unir sua equipe e reconstruir sua base de confiança antes que sejam dilacerados.

Jormungand: Perfect Order acompanha Koko e o restante de sua equipe enquanto enfrentam adversários persistentes, superam lutas internas e buscam tornar a visão de Koko de paz mundial uma realidade - onde tudo está em perfeita ordem.