Os aliens foram derrotados e o Sino foi transformado em uma gigantesca árvore de cerejeira. Agora, o corajoso Clube de Usuários de Magia precisa se reunir novamente para lidar com um novo problema. Aparentemente, algumas pessoas inconvenientes deixaram uma árvore de cerejeira do tamanho de um arranha-céu no meio de Tóquio, e ela se tornou um grande incômodo para todos na cidade. Mesmo sem saber quem poderia ter feito tal coisa, o Clube se sente estranhamente responsável e entra em ação. Enquanto isso, uma pessoa misteriosa está espionando o clube de magia na forma de um menino pequeno.