A história gira em torno de Akira Nikaido, um típico preguiçoso estudante do ensino médio que vive uma vida normal. Isso é, até que ele conhece o misterioso Shirogane, um homem que aparece de repente e diz a ele que eles têm um destino juntos. Quando Akira ouve isso, fica chocado e não acredita em uma palavra disso. Aya, uma amiga de Akira, esquece algo na escola uma noite e pede a Akira para ajudá-la a encontrá-lo. Ele concorda, e enquanto está lá, é atacado por uma criatura sombria. Shirogane o convence de que o equilíbrio entre o mundo humano e o mundo sombrio foi distorcido e que Akira deve se tornar um ""shin"" - uma criatura do mundo sombrio - para ajudar a restaurar o equilíbrio. O anime tem temas shonen-ai que estão completamente ausentes no mangá.