Vivendo em um santuário com outros órfãos, Ouri Kagami não é estranho a cadáveres. Mas quando ele vê o patrono de seu orfanato, Keisei Tagami, aparentemente reviver o cadáver esfacelado da estudante Makina Hoshimura, ele não pode deixar de sentir-se incrivelmente chocado.

Intrigado pelas circunstâncias misteriosas em torno de Makina, ele descobre que ela é uma Shikabane Hime - um ser morto-vivo encarregado de eliminar outros como ela que representam uma ameaça para a sociedade. À medida que Ouri segue sua vida diária, seus encontros inexplicáveis com ela são envoltos em anormalidade. Mas à medida que cada encontro se torna mais intenso, os dois são levados mais perto um do outro, e pode ser o destino de ambos que detém a chave para revelar os segredos por trás do mundo dos Shikabanes.